El Consejo Superior es el máximo órgano de dirección y está integrado por doce miembros y entre sus funciones están la de velar porque la Universidad permanezca dentro de los principios filosóficos que inspiraron su creación, formular, definir y evaluar periódicamente las políticas y objetivos generales de la Universidad; evaluar el informe semestral y aprobar los estados financieros anuales que presentan la Junta Directiva y el Rector. También nombran los miembros de la Junta Directiva y autorizan la creación de programas de pregrado y de maestrías.

Henry Éder Caicedo
Presidente Junta Directiva Manuelita S.A.

Francisco José Barberi Ospina
Presidente Tecnoquímicas S.A.

Óscar Varela Villegas
Gerente General de Invicol S.A.

Gustavo Adolfo Carvajal Sinisterra
Embajador de Colombia en Francia

Jorge Enrique Botero Uribe
Gerente Promotora Botero Uribe

Mauricio Cabrera Galvis
Director Cabrera, Bedoya & Asociados

Augusto Solano  Mejía
Presidente Asocolflores

Mauricio Iragorri Rizo
Gerente General Ingenio Mayagüez

Carlos Arcesio Paz Bautista
Gerente General Harinera del Valle

Ricardo Villaveces Pardo
Gerente RVP Consultores

Luis Ernesto Mejia Castro
Asesor externo de MAC S.A.